講演詳細

遺伝・育種部門[Forest Genetics and Tree Breeding]

日付	2023年3月26日
開始時刻	13:45
会場名	Room 1
講演番号	F4
発表題目	針葉樹４種のゲノム情報データベースBreedingTrees-by-Genesの構築 Construction of the genome database for four kinds of conifer trees, BreedingTrees-by-Genes
要旨本文	令和3年度から始まった農林水産研究推進事業委託プロジェクト研究では，Pacific Biosciences社のHiFiロングリードなどを用いて4樹種（カラマツ，ヒノキ，スギ，コウヨウザン）の高精度なゲノム配列が構築された．得られたゲノム配列を育種や学術研究などにおける基盤情報として提供するため， 4樹種のゲノム配列データを格納したBreedingTrees-by-Genes（ http://btg.kazusa.or.jp ）を公開した．本データベースでは，4樹種のゲノム配列に対するBLASTを用いた配列類似性検索やゲノム配列を入手することができる．さらに，森林総合研究所材木育種センターにて作製されたスギのカスタムアレイに用いられた34,371本のEST配列およびPacific Biosciences社のIso-Seqロングリードを用いて取得されたカラマツの完全長cDNA配列から予測された50,690本のORF配列といったトランスクリプトームデータについても本データベースから公開し集約させた．今後，ゲノムブラウザや代謝マップ表示などの機能を追加し，育種の効率化や高速化，遺伝子配列情報を活用した森林管理やゲノム編集研究への活用，進化解析などにおいてゲノムデータをより有効に活用できるデータベースの構築を目指す．
著者氏名	○平川英樹1 ・ 白澤健太1 ・ 井城泰一2 ・ 高島有哉3 ・ 福田有樹4 ・ 平尾知士5 ・ 三嶋賢太郎2
著者所属	1公益財団法人かずさDNA研究所 ・ 2国立研究開発法人 森林研究・整備機構 森林総合研究所林木育種センター東北育種場 ・ 3国立研究開発法人 森林研究・整備機構 森林総合研究所林木育種センター関西育種場 ・ 4国立研究開発法人 森林研究・整備機構 森林総合研究所林木育種センター九州育種場 ・ 5国立研究開発法人 森林研究・整備機構 森林総合研究所林木育種センター
キーワード	データベース, ゲノム配列, 針葉樹
Key word	Database, Genome sequence, Conifer trees